Loading
Medizinische Universität Graz   Hilfe

Meine Abschlussarbeiten - Publikationen

Abschlussarbeit(en) (Universitätslehrgang) - Detailansicht
Wichtigste Meldungen anzeigenMeldungsfenster schließen
Bibliografische Informationen
 Optimierung der molekulargenetischen Diagnostik von Retinitis pigmentosa  
 Erbliche Netzhauterkrankungen sind eine Gruppe von genetisch heterogenen Erkrankungen, für die eine Degeneration oder Funktionsstörung der Photorezeptoren in der Retina charakteristisch ist. Die häufigste ist Retinitis pigmentosa (RP) mit einer weltweiten Prävalenz zwischen 1:3000 und 1:7000. In bis zu 20% der Fälle wird die Erkrankung X-chromosomal vererbt und stellt die schwerwiegendste Form von RP dar. Dreiviertel der dafür ursächlichen Mutationen befinden sich im Mutationshotspot Exon ORF15 im Retinitis-pigmentosa-GTPase-Regulator-Gen (RPGR). Durch die repetitive Natur dieser Region ist es bis dato unmöglich diese Sequenz mittels Next Generation Sequencing (NGS) zu sequenzieren.

Im Rahmen dieser Masterthesis wurde eine deskriptive Übersicht aller molekulargenetischen Untersuchungen erstellt, die zwischen 2018 und Februar 2023 im Kontext klinischer Verdachtsdiagnosen erblich bedingter Augenerkrankungen am Diagnostik- und Forschungsinstitut für Humangenetik an der Medizinischen Universität Graz vorgenommen wurden. Weiters wurde an der Etablierung einer Methode gearbeitet, um die Sequenzierung von Exon ORF15 zu ermöglichen. Dazu wurde eine sogenannte Long-Range PCR etabliert, die ein 1,7 kb langes Amplikon generiert, welches die repetitive Sequenz umfasst. Nach einer umfassenden Testung mit Kontroll-DNA wurden ungelöste Fälle mit Verdacht auf RP analysiert.

Allerdings blieb aufgrund der Limitation von Short-Read Sequencing Technologien trotz einer größeren Sequenziertiefe und einer geringen Erhöhung der zugeordneten Reads in der stark repetitiven Region die Coverage im Bereich von c.2420 bis c.3080 weiterhin unzureichend. Die aus der Tagmentierung resultierende Länge der einzelnen Fragmente ist zu kurz, um beim Mapping von der Software richtig an das Referenzgenom aligniert zu werden.  
 Long-Range PCR, Exon ORF15, RPGR-Gen  
 
 2024  
   Volltext downloaden
Autorinnen*Autoren / Co-Autorinnen*Co-Autoren
  Reindl, Hanna; BSc
Betreuende Einrichtung / Studium
  Diagnostik & Forschungsinstitut für Humangenetik
 UO 992 730 Universitätslehrgang; MSc Medizinische Genetik  
Betreuung / Beurteilung
  Waldispühl-Geigl, Julie; Dr.scient.med.