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Bibliografische Informationen

Titel

Expression von miRNAs in A549-Zellen und Plasmaproben von Patienten mit Lungenadenokarzinom und gesunden Probanden

Kurzfassung

MicroRNAs (miRNAs) sind kleine nicht kodierende RNA-Moleküle, die an der Genregulation auf posttranskriptioneller Ebene beteiligt sind. Sie haben eine wichtige Rolle in verschiedenen biologischen Prozessen, aber auch in der Tumorentstehung. Mit dieser Dissertation erweitern wir das bestehende Wissen über miRNAs und ihre Rolle bei Lungenkrebs, mit dem Ziel zirkulierende miRNA zu finden, die als diagnostische Biomarker für die Früherkennung von Lungenkrebs dienen können. Im ersten Teil dieser Arbeit analysierten wir die globale Expression von 752 miRNAs in vitro in A549 Lungenadenokarzinom (LUAD)-Zellen und in primären, nicht-malignen Bronchialepithel (BE)-Zellen von gesunden Spendern und identifizierten die deregulierten miRNAs. Die Expression von 752 miRNAs in LUAD- und BE- Zellen wurde mittels reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) analysiert und mittels mean-centering restricted (MCR) Normalisierung ausgewertet. Von 752 miRNAs, waren 37 miRNAs in A549-Zellen im Vergleich zu BE-Zellen signifikant dereguliert. Nach der Einstellung von ΔΔCt ≥ 2,5 wurden achtzehn signifikant deregulierte miRNAs ausgewählt; 8 waren hoch- und-10 herunterreguliert. Basierend auf diesen in vitro Daten, untersuchten wir die miRNAs Expression in Plasmaproben von Patienten mit Lungenadenokarzinom und gesunden Spendern (n = 18 pro Gruppe). Wir fanden vier signifikant deregulierte miRNAs (miR-15b-3p, miR-148a-3p, miR-193b-3p und miR-195-5p) bei LUAD-Patienten im Vergleich zu Spenderproben. Eine miRNA (miR-195-5p) war hochreguliert und drei miRNAs (miR-15b-3p, miR148a-3p und miR-193b-3p) waren herunterreguliert. Zwei miRNAs wurden für die Normalisierung verwendet (miR-16-5p und miR-191-5p), aufgrund ihrer bekannten und nachgewiesenen Stabilität. Schließlich identifizierten wir mit verschiedenen in silico Tools die Zielgene, die von deregulierten zirkulierenden miRNAs beeinflusst werden und für die Biologie des Lungenadenokarzinoms relevant sind. Basierend auf der Literatur wurden 107 validierte Gene gefunden. Fünf davon (PTEN, CXCR4, IGF1R, FGF2 und PD-L1) wurden von mehr als einer von vier deregulierten miRNAs als reguliert beschrieben. Hundertsieben direkte Zielgene wurden der fünf funktionellen Gruppen zugeordnet: Bindung, katalytische Aktivität, molekularer Funktionsregulation, molekulare Transducer-Aktivität und Transportaktivität. Zusammenfassend konnten wir die relevanten Unterschiede zwischen Lungenkrebs- und Kontroll-miRNA-Expression in vitro und in Plasmaproben von LUAD-Patienten im Vergleich zu gesunden Spendern aufzeigen. Vier deregulierte miRNAs sind vielversprechend als diagnostischer Biomarker für das Lungenadenokarzinom.

Schlagwörter

Lungenkarzinom, diagnostischer Biomarker, microRNAs

Anzahl Seiten

Publikationsjahr

2024

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