| Hintergrund: Das Thema Qualitätssicherung in österreichischen Pathologien spielt zurzeit eine wichtige Rolle. Auf der einen Seite müssen in der Präzisionsmedizin und damit dem Versuch zu einer wirksamen Therapie eines einzelnen Patienten reproduzierbare und robuste Ergebnisse erzeugt werden, auf der anderen Seite verlangt die neue In-Vitro-Diagnostika-Verordnung (EU) 2017/746 die Erreichung der Akkreditierung EN ISO 15189:2012 bei Verwendung von nicht CE markierten Produkten. Deshalb ist ein korrekter Validierungsprozess, der ISO 15189 konform und unter Einhaltung aller relevanten Normen erstellt wird, zur Einführung des OncomineTM Focus Assays im Kaiser-Franz-Josef-Spital von großer Bedeutung.
Methode: Zu Validieren gilt es den OncomineTM Focus Assay der Firma ThermoFisher Scientific mittels der Next Generation Sequencing Technologie am Ion S5TM System. Dazu wurde eine externe Firma namens Sophia Genetics zur Unterstützung herangezogen. Diese hat vier Validierungsläufe hinsichtlich analytischer Sensitivität, analytischer Spezifität, Präzision, Genauigkeit, Wiederholbarkeit, Reproduzierbarkeit und Limit of Detection bewertet. Zusätzlich wurden hausintern weitere Proben analysiert, um auf eine Probenzahl von 105 zu kommen.
Ergebnisse: Der Assay konnte eine analytische Sensitivität von 96,25%, analytische Spezifität von 99,88%, Richtigkeit von 99,87% und Präzision von 72,64% erreichen. Die Sequenzier-Wiederholbarkeit beträgt 99,96%, die Varienten-Wiederholbarkeit 100%, die durchschnittliche Sequenzier-Reproduzierbarkeit 99,94% und die durchschnittliche Varianten-Reproduzierbarkeit 99,99% und weisen somit eine gute Sequenzier-Performance auf. Alle zusätzlichen Fälle stimmten zu 100% mit der Referenzmethode überein, es wurden höchstens zusätzliche wahrscheinlich pathogene Varianten detektiert.
Konklusion: Die Zusammenarbeit mit der Firma Sophia Genetics war erfolgreich, die Validierung konnte mit Einhaltung aller vorher definierten Spezifikationen der ISO 15189:2012 konform abgeschlossen werden und der Assay wurde schlussendlich in die Routinediagnostik des Kaiser-Franz-Josef-Spitals implementiert. |
