| Der Boden ist eine der heterogensten Umgebungen, die es gibt, vielleicht vor allem in der Verteilungsheterogenität der verschiedenen Bodenpartikel. Das Bodenmikrobiom teilt diese charakteristische Heterogenität, da die Bodenorganismen eine sehr heterogene Verteilung im Boden aufweisen. Dies macht es extrem schwierig, reproduzierbare Ergebnisse aus Bodenproben für die Mikrobiomforschung zu erhalten. Dies ist für ein breites Spektrum an Fachgebieten wie Landwirtschaft, Forstwirtschaft, Medizin und Biobanking von Bedeutung. Daher zielte diese Studie darauf ab, die Variabilität des Mikrobioms in einer Probe nach der Anwendung verschiedener Homogenisierungsverfahren zu vergleichen.
Es wurden Bodenproben von fünf verschiedenen Feldern gesammelt und in drei Gruppen eingeteilt. Die Proben der Gruppe 1 wurden einfach direkt aliquotiert und als Kontrolle verwendet. Die Proben der Gruppe 2 wurden nach der Homogenisierung mit einem Mixer zum Mischen und Disaggregieren der Bodenaggregate aliquotiert. Die Proben der Gruppe 3 wurden mit einem Mixer homogenisiert, um die Bodenaggregate zu mischen und zu disaggregieren, gefolgt von einer zweidimensionalen japanischen Slabcake-Technik, um die Auswirkung der Schichtung während der Probengrößenreduzierung vorweg zu reduzieren, und dann aliquotiert. Die Genomanalyse wurde an drei Aliquotes jeder Gruppe und jedes Feldes durchgeführt, um Bakterien und Pilze zu identifizieren und anschließend wurde eine bioinformatische Analyse durchgeführt.
Weniger Mikroheterogenität konnte in den Aliquots der Gruppe 3 als in den Aliquots der Gruppe 2 beobachtet werden. Aliquots aus beiden Behandlungsgruppen zeigten eine geringere Mikroheterogenität als Aliquots aus der Kontrollgruppe - Gruppe 1, die überhaupt nicht homogenisiert waren.
Die Homogenisierung von Bodenproben unter der Verwendung von Techniken zur inkrementellen Probensammlung hatte zur Folge, dass Aliquots dieser Proben weniger Variabilität in der Vielfalt an Bakterien und Pilzen in ihren Mikrobiomen aufwiesen. Die Homogenisierung von Proben unter Verwendung dieser speziellen Techniken ist besser als die Verwendung von Bodenproben, die nicht homogenisiert sind oder mit anderen Techniken homogenisiert werden, die nicht die gleichen Verzerrungs- und Fehlerquellen berücksichtigen.
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