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Meine Abschlussarbeiten - Publikationen

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Bibliografische Informationen
 Implementierung des AmoyDx® HRD Focus Panels zur Testung der homologen Rekombinationsdefizienz bei Ovarialkarzinom  
 Das Ovarialkarzinom, insbesondere das hochgradig seröse Ovarialkarzinom

(HGSOC), stellt einen bedeutenden Teil der gynäkologischen Malignome dar und

bleibt trotz seiner geringen Inzidenz eine tödliche Krankheit. Der Defekt in der

homologen Rekombinationsreparatur, der genetischen Variationen in essenziellen

Rekombinationsgenen, allen voran BRCA1 und BRCA2, zugeschrieben wird, ist ein

häufiges genetisches Merkmal von HGSOC. Homologe Rekombinationsdefizienz

(HRD) führt zu genomischer Instabilität, die zur Entwicklung von Eierstockkrebs

beiträgt. Die Entdeckung von Poly (ADP-Ribose)-Polymerase (PARP)-Inhibitoren

als potenzielle therapeutische Wirkstoffe, die mithilfe von synthetischer Letalität

defekte DNA-Reparaturwege abzielen, eröffnet eine vielversprechende

Behandlungsoption für Patientinnen mit HGSOC, sowohl in Rezidiv- als auch bei

Erstlinien-Behandlungen. HRD ist nun somit der erste phänotypisch definierte

prädiktive Marker für die Therapie mit PARP-Inhibitoren bei Eierstockkrebs. Mehrere

unterschiedliche PARP-Inhibitoren wurden bei Ovarialkarzionom bereits getestet,

und haben sich als neue selektive Therapie für hochgradigen Eierstockkrebs

erwiesen. Die Bewertung des HRD-Status, als entscheidender Faktor zur

Optimierung der klinischen Vorteile von PARP-Inhibitoren, wurde mithilfe des Myriad

myChoice® CDx Assays (Myriad Genetics, Salt Lake City, UT, USA) durchgeführt,

der kostenintensiv ist und zentralisiert in den USA durchgeführt wird.

Um die Notwendigkeit einer kosteneffektiven und zeitnahen Alternative zu

adressieren, untersuchte die vorliegende Arbeit die Leistung des kommerziell

verfügbaren AmoyDx® HRD Focus Panel (AmoyDx, Xiamen, China), das entwickelt

wurde, um HRD-positive Tumoren im Eierstockkrebs durch genomische Instabilität

zu identifizieren. Ziel war es, die Machbarkeit und Zuverlässigkeit dieses Assays im

Vergleich zu Myriad myChoice® CDx zu beurteilen und die

Übereinstimmungsergebnisse mit bestehenden Studien zu vergleichen. Die

Studienkohorte bestand aus 19 Patientinnen mit epithelialem Ovarialkarzinom

(EOC), wobei 15 davon mit dem CE-IVD AmoyDx® HRD Focus Panel analysiert

wurden. Die DNA, die aus formalinfixiertem Paraffineinbettungsgewebe (FFPE)

extrahiert wurde, wurde nach der Sequenzierung mithilfe der AmoyDx® NGS Data

Analysis System-ANDAS-Software analysiert, um gezielt Varianten in den Genen

BRCA1/2 zu identifizieren und den HRD-Status präzise zu bestimmen.

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Der Assay zeigte eine Erfolgsrate von 78,9%. Bemerkenswerterweise wies das

AmoyDx® HRD Focus Panel eine durchschnittliche Bearbeitungszeit (TAT) von 10

Tagen von der Testanforderung bis zu den verfügbaren Ergebnissen auf, deutlich

kürzer als die TAT von Myriad myChoice® CDx Assay (19,79 Tage), die auf den

langen Transportweg zurückzuführen ist. Die Übereinstimmungsanalyse ergab eine

Gesamtübereinstimmung (OPA) von 86,67%, wobei der positive prädiktive Wert

(PPA) bei 80% und der negative prädiktive Wert (NPA) bei 100% lagen. Die lineare

Korrelation (Pearson-Korrelationskoeffizient) zwischen Myriad und AmoyDx Score

betrug 0,93. Aktuelle Studien bestätigten diese Ergebnisse und zeigten die

Leistungsfähigkeit des AmoyDx® HRD Focus Panels sowie hohe Übereinstimmung

mit dem Myriad myChoice® CDx Assay.

Die Implementierung eines umfassenden internen Workflows für HRD-Tests ist

entscheidend, um eine schnelle und genaue Bestimmung des HRD-Status bei

HGSOC-Patientinnen zu gewährleisten. Die Kombination aus benutzerfreundlichem

Betrieb, Kosteneffektivität und schneller TAT macht das AmoyDx® HRD Focus

Panel zu einer geeigneten Wahl zur zuverlässigen Bestimmung des HRD-Status bei

HGSOC-Patientinnen  
 HRD; Ovarialkarzinom; PARP-Inhibitoren  
 
 2023  
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 Genetik
Autorinnen*Autoren / Co-Autorinnen*Co-Autoren
  Rohregger, Senka
Betreuende Einrichtung / Studium
  Diagnostik & Forschungsinstitut für Humangenetik
 UO 992 730 Universitätslehrgang; MSc Medizinische Genetik  
Betreuung / Beurteilung
  Petek, Erwin; Ao.Univ.-Prof. Mag. Dr. Dr.