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Bibliografische Informationen
 Sensitivity and Specificity of Sepsis Markers derived from Circulating Nucleic Acids  
 Hintergrund
Sepsis ist eine lebensbedrohliche Wirts-Reaktion auf eine Infektion. In dieser Studie wurden zirkulierende Nukleinsäuren (CNA) als diagnostische Marker (Motive) zur frühen Sepsis- Erkennung identifiziert. Seit den 1970er Jahren werden CNA als mögliche Marker in der Diagnostik von Erkrankungen gehandelt. Erst durch die Etablierung neuer Techniken wie „Next-Generation Sequencing“ konnten sie genauer untersucht werden. Wir nehmen an, dass im Plasma von Patienten, die eine Sepsis entwickeln, spezifische DNA-Motive vorhanden sind, die als diagnostische Marker in sehr frühen Stadien der Krankheit verwendet werden können. Zur Identifizierung dieser Motive wurde eine real-time PCR (qPCR) entwickelt.
Material und Methoden
Plasmaproben wurden gleichzeitig mit Blutkulturen von Sepsis PatientInnen abgenommen und mit Plasmaproben der Kontrollgruppe verglichen. CNA wurden aus Plasma isoliert und amplifiziert und mittels Illumina-Paired-End Methode sequenziert. Durch bioinformatische Analyse wurden Unterschiede in den Mustern von Erkrankten und Kontrollen charakterisiert. Anschließend wurde zur raschen Identifizierung jener Marker eine qPCR entwickelt.
Ergebnisse
Wir konnten 24 Motive identifizieren, die auf zirkulierenden Nukleinsäuren (CNA) basieren und in Kombination mit einer qPCR das Vorhandensein einer Sepsis zu einem sehr frühen Zeitpunkt nachweisen. Die Sepsis-Gruppe umfasste 147 Proben von 69 Patienten, welche die SEPSIS-3-Kriterien erfüllten. Die Kontrollkohorte bestand aus 71 Proben von 58 Personen, darunter gesunde Freiwillige sowie Influenza- und LymphompatientInnen. Die Treffergenauigkeit (balanced accuracy) der qPCR erreichte 89,6% bei einer Sensitivität von 93,8% und einer Spezifität von 85,4%.
Fazit
Durch den Wirt-basierten Ansatz ist es möglich die Entstehung einer Sepsis unabhängig vom verursachenden Erreger (Bakterien, Pilze) zu einem sehr frühen Zeitpunkt zu erfassen.  
 Sepsis; PCR; CNA; Sepsis marker  
 
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 Diagnostik in der Medizin
 Diagnostik in der Medizin
Autorinnen*Autoren / Co-Autorinnen*Co-Autoren
  König, Elisabeth; Dr.med.univ.
Betreuende Einrichtung / Studium
  Universitätsklinik für Innere Medizin
 UO 790 202 Dr.-Studium der medizin. Wissenschaft; Humanmedizin  
Betreuung / Beurteilung
  Krause, Robert; Univ.-Prof. Dr.med.univ.
  Leitner-Meyer, Eva; Priv.-Doz. Dr.scient.med.
  Heidinger, Petra; Mag.rer.nat. Dr.rer.nat.
  Sensen, Christoph; Univ.-Prof. Dipl.-Biol. Dr.rer.nat.