Medizinische Universität Graz

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Bibliografische Informationen

Titel

Charakterisierung des Mikrobioms in einem neu gebauten Krankenhaus

Kurzfassung

Heutzutage verbringen wir durchschnittlich 87% unserer Zeit in Innenräumen, aber es gibt nur wenig Kenntnisse über die mikrobiellen Gemeinschaften dieser Innenräume. Gerade im Krankenhausumfeld sind diese Mikroorganismen für unsere Gesundheit und unser Wohlbefinden von besonderer Bedeutung.
Hier untersuchen wir das Mikrobiom der neu gebauten chirurgischen Abteilung am Universitätsklinikum Graz, Österreich, indem wir Bakterien und Archaeen identifizieren und charakterisieren. Über einen Zeitraum von einem Jahr wurden an sieben verschiedenen Tagen (vor und in zunehmenden Abständen nach der Erstbelegung) Proben in drei Patientenzimmern der Abteilung für Allgemeine Chirurgie entnommen. Beispiele für Oberflächen sind Fußböden, Toiletten, Türgriffe und Kissen sowie selten berührte Oberflächen wie Lichtleisten. Nach DNA-Extraktion direkt aus der Probe und Amplifikation der hypervariablen Region V4 des 16s-rRNA-Gens wurde das gewonnene Material auf einer Illumina MiSeq-Plattform sequenziert. Die Sequenzierungsdaten wurden dann gefiltert, bereinigt und mit spezieller bioinformatischer Software (Qiime2, Calypso) analysiert. Neben der 16s-rRNA-Analyse wurden Abklatschtests an denselben Stellen durchgeführt.
Insgesamt werden die untersuchten Oberflächen von humanassoziierten Gattungen wie Corynebacterium, Staphylococcus, Streptococcus und Acinetobacter dominiert. Boden- und Türgriffproben weisen im Vergleich zu anderen Standorten die signifikant höchste Diversität auf, während Proben von Toiletten und Wasserhähnen einen signifikant geringen Reichtum an Mikroorganismen aufweisen. Es wurden außerdem saisonale Unterschiede festgestellt und gleichzeitig vorkommende Bakterienspezies konnten in Bezug auf die Oberflächentypen, auf denen sie gefunden wurden, gebündelt werden.
Diese Erkenntnisse könnten dazu beitragen, die Dynamik von Mikrobiomen in Krankenhäusern zu verstehen und operative Merkmale zu identifizieren, die diese Gemeinschaften beeinflussen, um beispielsweise die Ausbreitung von nosokomialen Krankheitserregern zu verhindern.

Schlagwörter

Mikrobiom, Krankenhaus, Nosokomiale Erreger

Anzahl Seiten

Publikationsjahr

2020

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