Medizinische Universität Graz

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Bibliografische Informationen

Titel

Evaluierung eines Assays zum schnellen Nachweis von Norovirus RNA - Vergleich zweier unterschiedlicher Extraktionssysteme

Kurzfassung

Hintergrund: Noroviren sind hochinfektiöse Erreger und gelten als die häufigste Ursache für Gastroenteritis-Ausbrüche. Um eine zuverlässige Diagnose zu stellen und klinische Entscheidungen treffen zu können, ist ein schneller und exakter Nachweis von Norovirus RNA von größter Bedeutung.
Zielsetzung: Das Ziel dieser Studie war der Vergleich des Anchor Norovirus PCR Kits (Anchor Diagnostics) unter Verwendung von zwei verschiedenen Extraktionsplattformen mit dem RIDA®GENE Norovirus Assay (R-Biopharm).
Materialien und Methoden: Die analytische Leistung des Anchor Norovirus PCR Kits wurde mit zwei Pilotstudien eines internationalen Ringversuchsprogrammes bestimmt. Die klinische Leistung wurde anhand von 109 anonymisierten Stuhlproben von PatientInnen mit Gastroenteritis untersucht. Zum Nachweis der Norovirus RNA wurde der Anchor Norovirus PCR Kit nach Extraktion auf der EMAG® (bioMerieux) bzw. auf der MagNA Pure 24 (Roche) Plattform verwendet. Der RIDA®GENE Norovirus Assay in Kombination mit der EMAG® Plattform diente als Referenzsystem. Die Amplifikation und der Nachweis der Norovirus RNA wurden für alle 3 Testsysteme mit dem Light Cycler® 480 II (Roche) durchgeführt.
Ergebnisse: Bei der Beurteilung der analytischen Leistung wurden alle Proben vom Anchor Norovirus PCR Kit in Kombination mit beiden Extraktionsverfahren korrekt identifiziert. In Bezug auf die klinische Leistung ergab der Referenztest 69 positive und 40 negative Ergebnisse. Bei der Extraktion mit der EMAG® Plattform lieferte das Anchor Norovirus PCR Kit 69 positive, 36 negative und 4 inhibierte Ergebnisse. In Kombination mit der MagNA Pure 24 Plattform waren 69 Proben positiv, 4 negativ und 36 inhibiert. Alle validen Ergebnisse stimmten überein. Die Gesamtzeit für eine Extraktion von 8 Proben mit der EMAG® Plattform war 80 Minuten, mit der MagNA Pure 24 Plattform 40 Minuten. Die manuelle Arbeitszeit betrug 20 bzw. 15 Minuten.
Fazit: Der schnelle Nachweis von Norovirus RNA ist von Vorteil, jedoch zeigte der Anchor Norovirus Kit in Kombination mit der MagNA Pure 24 Plattform eine signifikant erhöhte Zahl an Inhibierungen. In Kombination mit der EMAG® Plattform wurden mit dem Anchor Norovirus Kit signifikant weniger Inhibierungen beobachtet. Die Gesamtzeit der Testung ist mit der MagNA Pure 24 Plattform signifikant kürzer, jedoch können damit nur acht Proben gleichzeitig bearbeitet werden.

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2022

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