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Diplomarbeit - Detailansicht

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Bibliografische Informationen
 Expression von Genen, welche für G-Protein aktivierte einwärts gleichrichtende Kaliumkanäle (GIRKs) kodieren, in Mammatumoren  
 Hintergrund

Unter den vielen molekularen Mitspielern der Kanzerogenese sind kürzlich G Protein-gekoppelte Rezeptoren als wichtige Faktoren im Prozess der Tumorprogression und Metastasierung identifiziert worden. In vorhergehenden Studien an kleineren Kollektiven zeigte sich eine GIRK1 Protein-Überexpression in Brustkrebsgewebe. Eine hohe GIRK1 mRNA-Expression wurde mit Lymphknotenmetastasen assoziiert. In dieser Studie wollen wir diese Feststellung durch die Analyse von GIRK1 mRNA-Expressionsdaten an einem größeren Kollektiv untersuchen.



Methoden

Die GIRK1 mRNA Expressionsdaten von 914 Mammakarzinom-Gewebeproben, wurden über das cBio Portal mit den entsprechenden klinischen Daten aus dem UCSC Cancer Genomics Browser entnommen. Außerdem wurden mRNA Expressionsdaten von gesunden Geweben von 105 der oben erwähnten Patientinnen über das TCGA Portal heruntergeladen. Die mRNA- Daten und die klinischen Daten wurden mit Microsoft Excel 2010® verarbeitet und mit SigmaPlot v12.5® analysiert.



Ergebnisse

Die Analyse der TCGA Daten zeigte, dass GIRK1 in Brusttumoren im Vergleich zu Normalgewebe deutlich überexpremiert ist (p<0,001). Weiters ist GIRK1 in Östrogenrezeptor positiven Tumoren (p<0,001) und in Lymphknoten positiven Tumoren (p<0,001) im Vergleich zu Östrogenrezeptor negativen und Lymphknoten negativen Tumoren signifikant erhöht. Die Überlebensanalyse der TCGA Daten zeigte, dass die Hazardrate von GIRK1 signifikant beeinflusst wird (p<0,034).



Konklusion

Unsere Analyse der TCGA Daten zeigt, dass die Überexpression von GIRK1 mit Lymphknoten positivem als auch mit Östrogenrezeptor positivem Brustkrebs assoziiert ist und bestätigt damit frühere Erkenntnisse. Darüber hinaus konnten wir zeigen, dass eine GIRK1 Überexpression besonders bei Östrogenrezeptor positivem Brustkrebs einen negativen Einfluss auf das Gesamtüberleben hat.

 
   
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 2014  
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Autorinnen*Autoren / Co-Autorinnen*Co-Autoren
  Sokolowski, Armin Andreas; Dr.med.dent.
Betreuende Einrichtung / Studium
  Lehrstuhl für Medizinische Physik und Biophysik
 UO 202 Humanmedizin  
Betreuung / Beurteilung
  Schreibmayer, Wolfgang; Ao.Univ.-Prof. Dr.phil.
  Bauernhofer, Thomas; Univ.-Prof. Dr.med.univ.